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Atropos

Langue: en

Version: June 2010 (ubuntu - 24/10/10)

Section: 1 (Commandes utilisateur)

NAME

Atropos - part of ANTS registration suite

DESCRIPTION

COMMAND:

./Atropos
Atropos:
A priori classification with registration initialized template assistance.

OPTIONS:

-i, --initialization:
Option 1:
Random[numberOfClasses]
Option 2:
Kmeans[numberOfClasses]
Option 3:
Otsu[numberOfClasses]
Option 4:
PriorProbabilityImages[numberOfClasses,fileSeriesFormat(index=1 to numberOfClasses) or vectorImage,priorWeighting]
Option 5:
PriorLabelImage[numberOfClasses,labelImage,priorWeighting]
-a, --intensity-image:
[intensityImage,<adaptiveSmoothingWeight>] -- adaptive smoothing only applies to initialization with prior image(s)
-x, --mask-image:
maskImage
-c, --convergence:
[<numberOfIterations>,<convergenceThreshold>]
-k, --likelihood-model:
Option 1: Gaussian Option 2: ManifoldParzenWindows[<pointSetSigma=1.0>,<evaluationKNeighborhood=50>,<CovarianceKNeighborhood=0>,<kernelSigma=0>] Option 3: HistogramParzenWindows[<Sigma=1.0>,<numberOfBins=32>]
-m, --mrf:
[<smoothingFactor>,<radius>]
-o, --output:
[classifiedImage,<posteriorProbabilityImageFileNameFormat>]
-u, --minimize-memory-usage:
minimize-memory-usage=1/(0) <VALUES>: 0
-b, --bspline:
[<numberOfLevels>,<initialMeshResolution>,<splineOrder>] -- only applies to initialization with prior image(s) and non-zero adaptive smoothing parameter.
-e, --use-euclidean-distance:
use euclidean or geodesic distance for prior label distance maps = 1/(0) -- only applies to initialization with a prior label image. <VALUES>: 0
-w, --winsorize-outliers:
Option 1: BoxPlot[<lowerPercentile=0.25>,<upperPercentile=0.75>,<whiskerLength=1.5>] Option 2: GrubbsRosner[<significanceLevel=0.05>,<winsorizingLevel=0.10>]
-l, --labels:
whichLabel[sigma,<boundaryProbability>] -- only applies to initialization with a prior label image.
-h, --help:
Print menu. <VALUES>: 1, 0
Trois Anneaux pour les Rois Elfes sous le ciel,
Sept pour les Seigneurs Nains dans leurs demeures de pierre,
Neuf pour les Hommes Mortels destinés au trépas,
Un pour le Seigneur des Ténèbres sur son sombre trône
Dans le pays de Mordor où s'étendent les Ombres.
Un Anneau pour les gouverner tous, Un Anneau pour les trouver,
Un Anneau pour les amener tous et dans les ténèbres les lier
Au Pays de Mordor où s'étendent les Ombres.