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ugene

Langue: en

Version: 369348 (fedora - 01/12/10)

Section: 1 (Commandes utilisateur)

NAME

ugene - console version of UGENE(1)

SYNOPSIS

ugene [OPTIONS] [--scheme SCHEME [SHEME2...]] [--suite SUITE [SUITE2...]]

DESCRIPTION

ugene is a console version of UGENE(1) - visual environment for DNA and protein sequence analysis. ugene allows user to launch UGENE computational workflows or test suites from the command line and analyse the textual output.

OPTIONS

--help
Print a usage message briefly summarizing these command-line options and the program version, then exit.
--suite SUITE
Load and run UGENE test suite or test list.
--scheme SCHEME
Load and run workflow designer scheme.
--test-timeout=<number>
Set time out for tests.
--test-num-threads=<number>
Set number of threads for tests.
--teamcity-out
Output test's messages for TeamCity system.
--log-no-show-date
Don`t show date&time info at log.
--log-no-show-level
Don`t show message level at log.
--log-no-show-category
Don`t show message category at log.
--log-level-none
Don`t show log messages.
--log-level-error
Show only error log messages.
--log-level-info
Show error and info log messages (default).
--log-level-details
Show detailed information messages.
--log-level-trace
Show trace messages.
--no-task-status-bar
Don`t show task status bar.
--color-output
Colored output.
--load-settings-file=<filename>
Load custom UGENE settings file.

SEE ALSO

ugeneui(1)

BUGS

If you find a bug, please report it at ugene@unipro.ru.

AUTHOR

ugene was created by Unipro (http://unipro.ru)
Comment les théories mathématiques ont-elles ce pouvoir d'enserrer la
marche des phénomènes avec tant de précision et même de l'anticipation ?
Ce qui est mathématique peut être envisagé comme instrument mais aussi
parfois comme un comportement de la texture même du monde.
-+- Maurice Thirion, Les mathématiques et le réel -+-